L’ARS Ile-de-France est représentée dans chaque département par une délégation départementale. Ces délégations remplissent les missions de proximité de l’Agence. Elles sont en particulier l’interface locale des partenaires extérieurs : préfet, conseil général, établissements de santé, etc.
Chaque directeur/directrice de délégation départementale est membre du comité de direction de l’Agence.
Les délégations départementales sont localisées dans les chefs-lieux des départements.